Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms