Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA0408Q6ZU52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA0408Q6ZU52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA0408Q6ZU52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms