Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPOR1Q6ZS17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPOR1Q6ZS17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPOR1Q6ZS17 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms