Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYHR1Q6ZMK1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms