Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD2Q6Y1H2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACD2Q6Y1H2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms