Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms