Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT2Q6UVM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms