Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FIP1L1Q6UN15 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FIP1L1Q6UN15 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms