Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A10Q6U841 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SLC4A10Q6U841 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A10Q6U841 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A10Q6U841 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A10Q6U841 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms