Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOA5Q6Q788 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms