Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC174Q6PII3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms