Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTR9Q6PD62 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CTR9Q6PD62 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms