Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM4Q6P4Q7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM4Q6P4Q7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms