Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO42Q6P3S6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms