Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NTPCR-201ENST00000366627 1762 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.053e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 CEP192-210ENST00000513183 703 ntTSL 38.42□□□□□ -1.063e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 BABAM2-208ENST00000492702 616 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.143e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 ZNF547-201ENST00000282282 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.283e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 LSG1-205ENST00000461343 428 ntTSL 25.99□□□□□ -1.453e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 ZNF547-204ENST00000599604 602 ntTSL 35.85□□□□□ -1.473e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 SMARCC2-213ENST00000552627 409 ntTSL 34.63□□□□□ -1.673e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.743e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 ZZZ3-211ENST00000481346 4500 ntTSL 1 (best)2.55□□□□□ -23e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG9-205ENST00000527212 621 ntTSL 22.08□□□□□ -2.083e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5C1-209ENST00000480528 460 ntTSL 22□□□□□ -2.093e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 ALG9-204ENST00000526272 542 ntTSL 51.05□□□□□ -2.243e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.273e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 ZFC3H1-210ENST00000551487 746 ntTSL 30.83□□□□□ -2.283e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 PPA2-211ENST00000503171 585 ntTSL 40.53□□□□□ -2.321e-29■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 CEP290-208ENST00000604024 2741 ntTSL 1 (best)0.4□□□□□ -2.353e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 BZW1-213ENST00000491576 492 ntTSL 20.19□□□□□ -2.383e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 MITD1-208ENST00000483721 714 ntTSL 2-0.77□□□□□ -2.533e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 SMAD4-215ENST00000592911 475 ntTSL 57.99□□□□□ -1.134e-10■■■■■ 56.7
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PRPF8Q6P2Q9 MICU2-205ENST00000476895 716 ntTSL 52.35□□□□□ -2.032e-8■■■■■ 56.5
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PRPF8Q6P2Q9 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.548e-13■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 PIAS2-215ENST00000592212 2790 ntTSL 51.79□□□□□ -2.128e-13■■■■■ 56.3
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PRPF8Q6P2Q9 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 CASP10-213ENST00000492363 1477 ntTSL 24.98□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 CASP10-207ENST00000438843 888 ntTSL 23.99□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 56.3
PRPF8Q6P2Q9 G2E3-204ENST00000547532 623 ntTSL 30.35□□□□□ -2.352e-8■■■■■ 56.2
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 58.23□□□□□ -1.095e-16■■■■■ 56.2
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A2-227ENST00000498746 579 ntTSL 210.18□□□□□ -0.781e-17■■■■■ 56.2
PRPF8Q6P2Q9 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 52.7□□□□□ -1.985e-12■■■■■ 56.2
PRPF8Q6P2Q9 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 52.02□□□□□ -2.095e-12■■■■■ 56.2
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PRPF8Q6P2Q9 CSNK2A2-206ENST00000567730 947 ntTSL 35.97□□□□□ -1.457e-11■■■■■ 56.2
PRPF8Q6P2Q9 FAM135A-206ENST00000425415 2475 ntTSL 27.78□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 56.1
PRPF8Q6P2Q9 MRPS27-211ENST00000522042 578 ntTSL 47.72□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 56.1
PRPF8Q6P2Q9 MRPS27-214ENST00000522562 832 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 56.1
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-22■■■■■ 56
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PRPF8Q6P2Q9 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 27.4□□□□□ -1.234e-22■■■■■ 56
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