Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A4Q6P1M0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms