Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1J9

CDC73, Parafibromin, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC73Q6P1J9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC73Q6P1J9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC73Q6P1J9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC73Q6P1J9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms