Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL54Q6P161 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL54Q6P161 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms