Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3CQ6NXT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms