Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF544Q6NX49 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms