Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDD2Q6NTF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms