Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGB2Q6NT52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGB2Q6NT52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms