Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALGAPA1Q6GYQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RALGAPA1Q6GYQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms