Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT39Q6A163 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT39Q6A163 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms