Protein–RNA interactions for Protein: Q69YG0

TMEM42, Transmembrane protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM42Q69YG0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM42Q69YG0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM42Q69YG0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM42Q69YG0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms