Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHEQ5VZ18 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHEQ5VZ18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms