Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ECM29Q5VYK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ECM29Q5VYK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms