Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1QL3Q5VWW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1QL3Q5VWW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms