Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM208BQ5VWN6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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FAM208BQ5VWN6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM208BQ5VWN6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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