Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF18Q5VWM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms