Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP350Q5VT06 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP350Q5VT06 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP350Q5VT06 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms