Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3BQ5T9A4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3BQ5T9A4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms