Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF14Q5SWL7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF14Q5SWL7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms