Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms