Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAT1Q5SQI0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAT1Q5SQI0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms