Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
AMER1Q5JTC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AMER1Q5JTC6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
AMER1Q5JTC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AMER1Q5JTC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms