Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1JQ5JR12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1JQ5JR12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms