Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XKR4Q5GH76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XKR4Q5GH76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms