Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOM1Q5C9Z4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOM1Q5C9Z4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms