Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGO2Q562F6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms