Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms