Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHLDA2Q53GA4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA2Q53GA4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms