Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTC2Q53ET0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTC2Q53ET0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTC2Q53ET0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms