Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KRTAP13-3Q3SY46 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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KRTAP13-3Q3SY46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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KRTAP13-3Q3SY46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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KRTAP13-3Q3SY46 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-3Q3SY46 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-3Q3SY46 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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