Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UVSSAQ2YD98 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UVSSAQ2YD98 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UVSSAQ2YD98 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms