Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VMACQ2NL98 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VMACQ2NL98 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMACQ2NL98 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.8 ms