Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX7Q2KHR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFX7Q2KHR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms