Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF2Q1L5Z9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF2Q1L5Z9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF2Q1L5Z9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms