Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM183BQ1AE95 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM183BQ1AE95 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms