Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTL8BQ17RB0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTL8BQ17RB0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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